Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
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