Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms