Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF4Q15306 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms