Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
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