Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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