Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNB1Q14721 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms