Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTTNQ14247 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNQ14247 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms