Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
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