Protein–RNA interactions for Protein: Q14152

EIF3A, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3AQ14152 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF3AQ14152 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF3AQ14152 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF3AQ14152 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF3AQ14152 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF3AQ14152 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF3AQ14152 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF3AQ14152 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF3AQ14152 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF3AQ14152 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF3AQ14152 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF3AQ14152 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF3AQ14152 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF3AQ14152 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF3AQ14152 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF3AQ14152 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF3AQ14152 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF3AQ14152 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF3AQ14152 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3AQ14152 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms