Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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