Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCINQ13939 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCINQ13939 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCINQ13939 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCINQ13939 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCINQ13939 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCINQ13939 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCINQ13939 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCINQ13939 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCINQ13939 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCINQ13939 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCINQ13939 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCINQ13939 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCINQ13939 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCINQ13939 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCINQ13939 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCINQ13939 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCINQ13939 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCINQ13939 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CCINQ13939 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CCINQ13939 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCINQ13939 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCINQ13939 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCINQ13939 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCINQ13939 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCINQ13939 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCINQ13939 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCINQ13939 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCINQ13939 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCINQ13939 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCINQ13939 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCINQ13939 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCINQ13939 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCINQ13939 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCINQ13939 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCINQ13939 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCINQ13939 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCINQ13939 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCINQ13939 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCINQ13939 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCINQ13939 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCINQ13939 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCINQ13939 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCINQ13939 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCINQ13939 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCINQ13939 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCINQ13939 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCINQ13939 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCINQ13939 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCINQ13939 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCINQ13939 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCINQ13939 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCINQ13939 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCINQ13939 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCINQ13939 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCINQ13939 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCINQ13939 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCINQ13939 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCINQ13939 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCINQ13939 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCINQ13939 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCINQ13939 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCINQ13939 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCINQ13939 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCINQ13939 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCINQ13939 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCINQ13939 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCINQ13939 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCINQ13939 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCINQ13939 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCINQ13939 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCINQ13939 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCINQ13939 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCINQ13939 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCINQ13939 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCINQ13939 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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