Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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