Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms