Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNASE1L3Q13609 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms