Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
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