Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
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