Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNTB2Q13425 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNTB2Q13425 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNTB2Q13425 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNTB2Q13425 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNTB2Q13425 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNTB2Q13425 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNTB2Q13425 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNTB2Q13425 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNTB2Q13425 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNTB2Q13425 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNTB2Q13425 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNTB2Q13425 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNTB2Q13425 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNTB2Q13425 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNTB2Q13425 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB2Q13425 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms