Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms