Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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