Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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NR1H3Q13133 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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NR1H3Q13133 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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NR1H3Q13133 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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NR1H3Q13133 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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NR1H3Q13133 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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NR1H3Q13133 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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NR1H3Q13133 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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NR1H3Q13133 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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NR1H3Q13133 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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NR1H3Q13133 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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NR1H3Q13133 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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