Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RESTQ13127 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RESTQ13127 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RESTQ13127 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RESTQ13127 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RESTQ13127 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RESTQ13127 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RESTQ13127 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RESTQ13127 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RESTQ13127 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RESTQ13127 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RESTQ13127 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RESTQ13127 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RESTQ13127 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RESTQ13127 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RESTQ13127 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RESTQ13127 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RESTQ13127 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RESTQ13127 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RESTQ13127 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RESTQ13127 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RESTQ13127 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RESTQ13127 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RESTQ13127 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RESTQ13127 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RESTQ13127 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RESTQ13127 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RESTQ13127 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RESTQ13127 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RESTQ13127 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RESTQ13127 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RESTQ13127 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RESTQ13127 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RESTQ13127 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RESTQ13127 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RESTQ13127 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RESTQ13127 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RESTQ13127 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RESTQ13127 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RESTQ13127 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RESTQ13127 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RESTQ13127 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RESTQ13127 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RESTQ13127 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RESTQ13127 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RESTQ13127 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RESTQ13127 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RESTQ13127 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RESTQ13127 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RESTQ13127 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RESTQ13127 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RESTQ13127 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RESTQ13127 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RESTQ13127 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RESTQ13127 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RESTQ13127 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RESTQ13127 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RESTQ13127 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RESTQ13127 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RESTQ13127 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RESTQ13127 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RESTQ13127 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RESTQ13127 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RESTQ13127 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RESTQ13127 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RESTQ13127 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RESTQ13127 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RESTQ13127 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RESTQ13127 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RESTQ13127 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RESTQ13127 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RESTQ13127 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RESTQ13127 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RESTQ13127 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RESTQ13127 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RESTQ13127 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RESTQ13127 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RESTQ13127 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RESTQ13127 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RESTQ13127 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RESTQ13127 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RESTQ13127 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RESTQ13127 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RESTQ13127 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RESTQ13127 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RESTQ13127 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RESTQ13127 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RESTQ13127 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RESTQ13127 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RESTQ13127 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RESTQ13127 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RESTQ13127 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RESTQ13127 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RESTQ13127 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RESTQ13127 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RESTQ13127 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RESTQ13127 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RESTQ13127 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RESTQ13127 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RESTQ13127 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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