Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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