Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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