Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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