Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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