Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
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