Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms