Protein–RNA interactions for Protein: Q12460

NOP56, Nucleolar protein 56, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP56Q12460 SET3YKR029C 2256 nt1.55□□□□□ -2.16
NOP56Q12460 EST2YLR318W 2655 nt1.54□□□□□ -2.16
NOP56Q12460 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.54□□□□□ -2.16
NOP56Q12460 YLR422WYLR422W 5799 nt1.54□□□□□ -2.16
NOP56Q12460 CFT1YDR301W 4074 nt1.53□□□□□ -2.16
NOP56Q12460 MDS3YGL197W 4464 nt1.53□□□□□ -2.16 RIP-Chip
NOP56Q12460 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.53□□□□□ -2.16
NOP56Q12460 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.52□□□□□ -2.17
NOP56Q12460 APL1YJR005W 2103 nt1.51□□□□□ -2.17 RIP-Chip
NOP56Q12460 NUP145YGL092W 3954 nt1.51□□□□□ -2.17
NOP56Q12460 APL3YBL037W 3078 nt1.51□□□□□ -2.17
NOP56Q12460 WAR1YML076C 2835 nt1.5□□□□□ -2.17
NOP56Q12460 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.5□□□□□ -2.17
NOP56Q12460 COA6YMR244C-A 315 nt1.5□□□□□ -2.17
NOP56Q12460 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.5□□□□□ -2.17
NOP56Q12460 YOR345CYOR345C 351 nt1.5□□□□□ -2.17
NOP56Q12460 FIG2YCR089W 4830 nt1.49□□□□□ -2.17
NOP56Q12460 NUP188YML103C 4968 nt1.49□□□□□ -2.17
NOP56Q12460 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.49□□□□□ -2.17
NOP56Q12460 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.49□□□□□ -2.17
NOP56Q12460 BRR2YER172C 6492 nt1.48□□□□□ -2.17
NOP56Q12460 SAC3YDR159W 3906 nt1.48□□□□□ -2.17
NOP56Q12460 YLL020CYLL020C 306 nt1.47□□□□□ -2.17
NOP56Q12460 EAF1YDR359C 2949 nt1.47□□□□□ -2.17
NOP56Q12460 RSM22YKL155C 1887 nt1.46□□□□□ -2.18
NOP56Q12460 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.46□□□□□ -2.18
NOP56Q12460 TRM732YMR259C 4263 nt1.46□□□□□ -2.18
NOP56Q12460 MSN5YDR335W 3675 nt1.45□□□□□ -2.18
NOP56Q12460 PAA1YDR071C 576 nt1.45□□□□□ -2.18
NOP56Q12460 YNL211CYNL211C 261 nt1.45□□□□□ -2.18
NOP56Q12460 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.43□□□□□ -2.18
NOP56Q12460 SEC3YER008C 4011 nt1.43□□□□□ -2.18
NOP56Q12460 CLU1YMR012W 3834 nt1.42□□□□□ -2.18
NOP56Q12460 RPS30BYOR182C 192 nt1.42□□□□□ -2.18
NOP56Q12460 RAD9YDR217C 3930 nt1.42□□□□□ -2.18
NOP56Q12460 TTI1YKL033W 3117 nt1.42□□□□□ -2.18
NOP56Q12460 GEA2YEL022W 4380 nt1.41□□□□□ -2.18
NOP56Q12460 Q0032Q0032 291 nt1.41□□□□□ -2.18
NOP56Q12460 YJL182CYJL182C 318 nt1.41□□□□□ -2.18
NOP56Q12460 CMC4YMR194C-B 222 nt1.41□□□□□ -2.18
NOP56Q12460 YNL198CYNL198C 303 nt1.41□□□□□ -2.18
NOP56Q12460 RPL33BYOR234C 324 nt1.41□□□□□ -2.18
NOP56Q12460 snR46snR46 197 nt1.41□□□□□ -2.18
NOP56Q12460 NOP9YJL010C 2001 nt1.4□□□□□ -2.18
NOP56Q12460 ROM2YLR371W 4071 nt1.4□□□□□ -2.19
NOP56Q12460 HAL9YOL089C 3093 nt1.38□□□□□ -2.19
NOP56Q12460 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt1.38□□□□□ -2.19
NOP56Q12460 COX12YLR038C 252 nt1.38□□□□□ -2.19
NOP56Q12460 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt1.38□□□□□ -2.19
NOP56Q12460 YPL044CYPL044C 549 nt1.38□□□□□ -2.19
NOP56Q12460 snR52snR52 92 nt1.38□□□□□ -2.19
NOP56Q12460 CDC25YLR310C 4770 nt1.37□□□□□ -2.19
NOP56Q12460 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.37□□□□□ -2.19
NOP56Q12460 YJL150WYJL150W 303 nt1.37□□□□□ -2.19
NOP56Q12460 YOR225WYOR225W 330 nt1.37□□□□□ -2.19
NOP56Q12460 STB6YKL072W 2301 nt1.37□□□□□ -2.19
NOP56Q12460 NUP157YER105C 4176 nt1.36□□□□□ -2.19
NOP56Q12460 YGR151CYGR151C 336 nt1.36□□□□□ -2.19
NOP56Q12460 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt1.36□□□□□ -2.19
NOP56Q12460 COY1YKL179C 2040 nt1.35□□□□□ -2.19
NOP56Q12460 CDC39YCR093W 6327 nt1.35□□□□□ -2.19
NOP56Q12460 RPL26BYGR034W 384 nt1.35□□□□□ -2.19
NOP56Q12460 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.34□□□□□ -2.19
NOP56Q12460 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.34□□□□□ -2.19
NOP56Q12460 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.33□□□□□ -2.2
NOP56Q12460 YEL073CYEL073C 324 nt1.32□□□□□ -2.2
NOP56Q12460 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.32□□□□□ -2.2
NOP56Q12460 NUP192YJL039C 5052 nt1.31□□□□□ -2.2
NOP56Q12460 CAT8YMR280C 4302 nt1.31□□□□□ -2.2
NOP56Q12460 PRP39YML046W 1890 nt1.31□□□□□ -2.2
NOP56Q12460 PMP1YCR024C-A 123 nt1.3□□□□□ -2.2
NOP56Q12460 COX5BYIL111W 456 nt1.3□□□□□ -2.2
NOP56Q12460 YLR282CYLR282C 342 nt1.3□□□□□ -2.2
NOP56Q12460 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.29□□□□□ -2.2
NOP56Q12460 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.28□□□□□ -2.2
NOP56Q12460 snR190snR190 190 nt1.27□□□□□ -2.21
NOP56Q12460 YML002WYML002W 2214 nt1.26□□□□□ -2.21
NOP56Q12460 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.26□□□□□ -2.21
NOP56Q12460 TRS65YGR166W 1683 nt1.25□□□□□ -2.21
NOP56Q12460 UTP8YGR128C 2142 nt1.25□□□□□ -2.21
NOP56Q12460 VAM6YDL077C 3150 nt1.24□□□□□ -2.21
NOP56Q12460 CDC31YOR257W 486 nt1.24□□□□□ -2.21
NOP56Q12460 ASE1YOR058C 2658 nt1.23□□□□□ -2.21 RIP-Chip
NOP56Q12460 PRP5YBR237W 2550 nt1.23□□□□□ -2.21
NOP56Q12460 PRP42YDR235W 1635 nt1.22□□□□□ -2.21
NOP56Q12460 KAP120YPL125W 3099 nt1.22□□□□□ -2.21
NOP56Q12460 SEC8YPR055W 3198 nt1.22□□□□□ -2.21
NOP56Q12460 BFR2YDR299W 1605 nt1.22□□□□□ -2.21
NOP56Q12460 YNL338WYNL338W 159 nt1.21□□□□□ -2.22 RIP-Chip
NOP56Q12460 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt1.21□□□□□ -2.22
NOP56Q12460 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.2□□□□□ -2.22
NOP56Q12460 YLR294CYLR294C 330 nt1.2□□□□□ -2.22
NOP56Q12460 FYV10YIL097W 1551 nt1.18□□□□□ -2.22
NOP56Q12460 NST1YNL091W 3723 nt1.17□□□□□ -2.22
NOP56Q12460 YLR041WYLR041W 321 nt1.17□□□□□ -2.22
NOP56Q12460 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.17□□□□□ -2.22
NOP56Q12460 MSH3YCR092C 3057 nt1.17□□□□□ -2.22
NOP56Q12460 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.16□□□□□ -2.22
NOP56Q12460 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.16□□□□□ -2.22
NOP56Q12460 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.16□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.5 ms