Protein–RNA interactions for Protein: Q12457

NSI1, RNA polymerase I termination factor, yeastyeast

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSI1Q12457 CHC1YGL206C 4962 nt2.22□□□□□ -2.05
NSI1Q12457 APL1YJR005W 2103 nt2.21□□□□□ -2.06
NSI1Q12457 SYH1YPL105C 2550 nt2.21□□□□□ -2.06
NSI1Q12457 IST2YBR086C 2841 nt2.2□□□□□ -2.06
NSI1Q12457 HIR3YJR140C 4947 nt2.2□□□□□ -2.06
NSI1Q12457 SCP160YJL080C 3669 nt2.2□□□□□ -2.06
NSI1Q12457 RTT101YJL047C 2529 nt2.2□□□□□ -2.06
NSI1Q12457 UFD2YDL190C 2886 nt2.19□□□□□ -2.06
NSI1Q12457 RPL37BYDR500C 267 nt2.19□□□□□ -2.06
NSI1Q12457 MAK10YEL053C 2202 nt2.19□□□□□ -2.06
NSI1Q12457 UFD4YKL010C 4452 nt2.19□□□□□ -2.06
NSI1Q12457 DNF1YER166W 4716 nt2.19□□□□□ -2.06
NSI1Q12457 TDA9YML081W 3756 nt2.19□□□□□ -2.06
NSI1Q12457 PET309YLR067C 2898 nt2.18□□□□□ -2.06
NSI1Q12457 PKH2YOL100W 3246 nt2.18□□□□□ -2.06
NSI1Q12457 YLL020CYLL020C 306 nt2.17□□□□□ -2.06
NSI1Q12457 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt2.17□□□□□ -2.06
NSI1Q12457 UBP2YOR124C 3819 nt2.17□□□□□ -2.06
NSI1Q12457 YDL206WYDL206W 2289 nt2.16□□□□□ -2.06
NSI1Q12457 FRK1YPL141C 2598 nt2.16□□□□□ -2.06
NSI1Q12457 DCP2YNL118C 2913 nt2.15□□□□□ -2.06
NSI1Q12457 HER1YOR227W 3741 nt2.15□□□□□ -2.06
NSI1Q12457 AGC1YPR021C 2709 nt2.15□□□□□ -2.06
NSI1Q12457 TFC3YAL001C 3483 nt2.15□□□□□ -2.07
NSI1Q12457 snR62snR62 100 nt2.15□□□□□ -2.07
NSI1Q12457 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt2.15□□□□□ -2.07
NSI1Q12457 STH1YIL126W 4080 nt2.15□□□□□ -2.07
NSI1Q12457 SAC3YDR159W 3906 nt2.13□□□□□ -2.07
NSI1Q12457 SLI15YBR156C 2097 nt2.13□□□□□ -2.07
NSI1Q12457 TRM3YDL112W 4311 nt2.13□□□□□ -2.07
NSI1Q12457 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt2.13□□□□□ -2.07
NSI1Q12457 BPH1YCR032W 6504 nt2.13□□□□□ -2.07
NSI1Q12457 CTR9YOL145C 3234 nt2.12□□□□□ -2.07
NSI1Q12457 BUD2YKL092C 3315 nt2.12□□□□□ -2.07
NSI1Q12457 SEC16YPL085W 6588 nt2.12□□□□□ -2.07
NSI1Q12457 RTP1YMR185W 2946 nt2.11□□□□□ -2.07
NSI1Q12457 YDR210WYDR210W 228 nt2.11□□□□□ -2.07
NSI1Q12457 MGA2YIR033W 3342 nt2.11□□□□□ -2.07
NSI1Q12457 YMR045CYMR045C 5268 nt2.11□□□□□ -2.07
NSI1Q12457 TAH1YCR060W 336 nt2.1□□□□□ -2.07
NSI1Q12457 RGA1YOR127W 3024 nt2.1□□□□□ -2.07
NSI1Q12457 NUT1YGL151W 3399 nt2.1□□□□□ -2.07
NSI1Q12457 KAP120YPL125W 3099 nt2.09□□□□□ -2.07
NSI1Q12457 SEC31YDL195W 3822 nt2.09□□□□□ -2.07
NSI1Q12457 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.08□□□□□ -2.08
NSI1Q12457 SPP41YDR464W 4308 nt2.08□□□□□ -2.08
NSI1Q12457 YDL073WYDL073W 2955 nt2.07□□□□□ -2.08
NSI1Q12457 ADR1YDR216W 3972 nt2.07□□□□□ -2.08
NSI1Q12457 UTP22YGR090W 3714 nt2.07□□□□□ -2.08
NSI1Q12457 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.07□□□□□ -2.08
NSI1Q12457 KOG1YHR186C 4674 nt2.07□□□□□ -2.08
NSI1Q12457 COA6YMR244C-A 315 nt2.07□□□□□ -2.08
NSI1Q12457 COX5BYIL111W 456 nt2.06□□□□□ -2.08
NSI1Q12457 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt2.06□□□□□ -2.08
NSI1Q12457 BIR1YJR089W 2865 nt2.06□□□□□ -2.08
NSI1Q12457 ATG9YDL149W 2994 nt2.05□□□□□ -2.08
NSI1Q12457 DGR1YNL130C-A 147 nt2.05□□□□□ -2.08
NSI1Q12457 ALY2YJL084C 3141 nt2.05□□□□□ -2.08
NSI1Q12457 IRE1YHR079C 3348 nt2.05□□□□□ -2.08
NSI1Q12457 UBR2YLR024C 5619 nt2.05□□□□□ -2.08
NSI1Q12457 YLR041WYLR041W 321 nt2.04□□□□□ -2.08
NSI1Q12457 NEO1YIL048W 3456 nt2.04□□□□□ -2.08
NSI1Q12457 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt2.03□□□□□ -2.08
NSI1Q12457 SPO24YPR036W-A 204 nt2.03□□□□□ -2.08
NSI1Q12457 MSH6YDR097C 3729 nt2.03□□□□□ -2.08
NSI1Q12457 SEY1YOR165W 2331 nt2.03□□□□□ -2.08
NSI1Q12457 TBS1YBR150C 3285 nt2.03□□□□□ -2.08
NSI1Q12457 USO1YDL058W 5373 nt2.03□□□□□ -2.09
NSI1Q12457 MYO4YAL029C 4416 nt2.02□□□□□ -2.09
NSI1Q12457 BRE1YDL074C 2103 nt2.02□□□□□ -2.09
NSI1Q12457 TOR2YKL203C 7425 nt2.01□□□□□ -2.09
NSI1Q12457 YNL266WYNL266W 420 nt2.01□□□□□ -2.09
NSI1Q12457 ASE1YOR058C 2658 nt2.01□□□□□ -2.09
NSI1Q12457 SEC1YDR164C 2175 nt2□□□□□ -2.09
NSI1Q12457 TRM732YMR259C 4263 nt2□□□□□ -2.09
NSI1Q12457 RAD9YDR217C 3930 nt2□□□□□ -2.09
NSI1Q12457 PAN2YGL094C 3348 nt1.99□□□□□ -2.09
NSI1Q12457 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.98□□□□□ -2.09
NSI1Q12457 TMA7YLR262C-A 195 nt1.98□□□□□ -2.09
NSI1Q12457 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt1.98□□□□□ -2.09
NSI1Q12457 KCS1YDR017C 3153 nt1.98□□□□□ -2.09
NSI1Q12457 YLR232WYLR232W 348 nt1.97□□□□□ -2.09
NSI1Q12457 FKS1YLR342W 5631 nt1.96□□□□□ -2.1
NSI1Q12457 SFB2YNL049C 2631 nt1.95□□□□□ -2.1
NSI1Q12457 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.95□□□□□ -2.1
NSI1Q12457 RPS26AYGL189C 360 nt1.94□□□□□ -2.1
NSI1Q12457 snR14snR14 160 nt1.94□□□□□ -2.1
NSI1Q12457 RSM22YKL155C 1887 nt1.94□□□□□ -2.1
NSI1Q12457 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt1.93□□□□□ -2.1
NSI1Q12457 YAR009CYAR009C 3591 nt1.93□□□□□ -2.1
NSI1Q12457 SET3YKR029C 2256 nt1.93□□□□□ -2.1
NSI1Q12457 UTP21YLR409C 2820 nt1.92□□□□□ -2.1
NSI1Q12457 YCS4YLR272C 3531 nt1.92□□□□□ -2.1
NSI1Q12457 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1.92□□□□□ -2.1
NSI1Q12457 GCN2YDR283C 4980 nt1.92□□□□□ -2.1
NSI1Q12457 YML002WYML002W 2214 nt1.91□□□□□ -2.1
NSI1Q12457 GYP5YPL249C 2685 nt1.91□□□□□ -2.1
NSI1Q12457 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt1.91□□□□□ -2.1
NSI1Q12457 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt1.91□□□□□ -2.1
NSI1Q12457 FYV10YIL097W 1551 nt1.9□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.4 ms