Protein–RNA interactions for Protein: Q12329

HSP42, Heat shock protein 42, yeastyeast

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HSP42Q12329 MCM10YIL150C 1716 nt1.04□□□□□ -2.24
HSP42Q12329 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.04□□□□□ -2.24
HSP42Q12329 STE5YDR103W 2754 nt1.03□□□□□ -2.24
HSP42Q12329 YDL196WYDL196W 330 nt1.02□□□□□ -2.25
HSP42Q12329 OLI1Q0130 231 nt1.02□□□□□ -2.25
HSP42Q12329 VIK1YPL253C 1944 nt1.02□□□□□ -2.25
HSP42Q12329 YGL149WYGL149W 306 nt1.01□□□□□ -2.25
HSP42Q12329 YMR321CYMR321C 318 nt1.01□□□□□ -2.25
HSP42Q12329 BUD3YCL014W 4911 nt1.01□□□□□ -2.25
HSP42Q12329 YJR029WYJR029W 5268 nt1.01□□□□□ -2.25
HSP42Q12329 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.01□□□□□ -2.25
HSP42Q12329 QCR9YGR183C 201 nt1□□□□□ -2.25
HSP42Q12329 YDL073WYDL073W 2955 nt1□□□□□ -2.25
HSP42Q12329 ASE1YOR058C 2658 nt0.99□□□□□ -2.25
HSP42Q12329 RPL39YJL189W 156 nt0.99□□□□□ -2.25
HSP42Q12329 SGF11YPL047W 300 nt0.99□□□□□ -2.25
HSP42Q12329 RPS27BYHR021C 249 nt0.98□□□□□ -2.25
HSP42Q12329 YOR015WYOR015W 360 nt0.98□□□□□ -2.25
HSP42Q12329 RKR1YMR247C 4689 nt0.98□□□□□ -2.25
HSP42Q12329 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.97□□□□□ -2.25
HSP42Q12329 ALG13YGL047W 609 nt0.97□□□□□ -2.25
HSP42Q12329 YNL211CYNL211C 261 nt0.97□□□□□ -2.25
HSP42Q12329 PAM16YJL104W 450 nt0.96□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 CMC4YMR194C-B 222 nt0.96□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt0.96□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 SMC1YFL008W 3678 nt0.96□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 BFR2YDR299W 1605 nt0.96□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 NOP9YJL010C 2001 nt0.95□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.95□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.95□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.95□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.95□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.95□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.95□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 CSE2YNR010W 450 nt0.95□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.94□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 RAD61YDR014W 1944 nt0.93□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 ISD11YER048W-A 285 nt0.93□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 YOR218CYOR218C 420 nt0.93□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.92□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 IES4YOR189W 351 nt0.92□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 YPL044CYPL044C 549 nt0.92□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 PRP16YKR086W 3216 nt0.92□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 PMP1YCR024C-A 123 nt0.91□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt0.91□□□□□ -2.26
HSP42Q12329 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.9□□□□□ -2.27
HSP42Q12329 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.9□□□□□ -2.27
HSP42Q12329 YNL028WYNL028W 318 nt0.9□□□□□ -2.27
HSP42Q12329 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.89□□□□□ -2.27
HSP42Q12329 YNL146WYNL146W 303 nt0.89□□□□□ -2.27
HSP42Q12329 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.88□□□□□ -2.27
HSP42Q12329 YGR069WYGR069W 336 nt0.87□□□□□ -2.27
HSP42Q12329 YOR282WYOR282W 321 nt0.87□□□□□ -2.27
HSP42Q12329 PAA1YDR071C 576 nt0.86□□□□□ -2.27
HSP42Q12329 snR65snR65 100 nt0.85□□□□□ -2.27
HSP42Q12329 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.85□□□□□ -2.27
HSP42Q12329 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.85□□□□□ -2.27
HSP42Q12329 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.85□□□□□ -2.27
HSP42Q12329 YMR160WYMR160W 2451 nt0.84□□□□□ -2.27
HSP42Q12329 snR74snR74 88 nt0.83□□□□□ -2.28
HSP42Q12329 YGL052WYGL052W 306 nt0.83□□□□□ -2.28
HSP42Q12329 RPL26BYGR034W 384 nt0.83□□□□□ -2.28
HSP42Q12329 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.83□□□□□ -2.28
HSP42Q12329 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.82□□□□□ -2.28
HSP42Q12329 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt0.82□□□□□ -2.28
HSP42Q12329 YPR092WYPR092W 306 nt0.82□□□□□ -2.28
HSP42Q12329 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.81□□□□□ -2.28
HSP42Q12329 CHS6YJL099W 2241 nt0.8□□□□□ -2.28
HSP42Q12329 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.8□□□□□ -2.28
HSP42Q12329 BIR1YJR089W 2865 nt0.78□□□□□ -2.28
HSP42Q12329 YOL014WYOL014W 375 nt0.78□□□□□ -2.28
HSP42Q12329 NPR2YEL062W 1848 nt0.78□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.77□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.77□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.76□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 snR190snR190 190 nt0.76□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 PRP5YBR237W 2550 nt0.76□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 LTE1YAL024C 4308 nt0.75□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.75□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 COY1YKL179C 2040 nt0.75□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 FYV10YIL097W 1551 nt0.74□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.74□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 SEC8YPR055W 3198 nt0.73□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 YLR282CYLR282C 342 nt0.73□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.73□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 YML002WYML002W 2214 nt0.73□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 SEC1YDR164C 2175 nt0.73□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.72□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.72□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.72□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.72□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.72□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.72□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.72□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.72□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.72□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.72□□□□□ -2.29
HSP42Q12329 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.72□□□□□ -2.29
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