Protein–RNA interactions for Protein: Q12209

FRE8, Probable ferric reductase transmembrane component 8, yeastyeast

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FRE8Q12209 SPO21YOL091W 1830 nt0.83□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 YDL196WYDL196W 330 nt0.83□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 OLI1Q0130 231 nt0.83□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 RPL39YJL189W 156 nt0.83□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.83□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 ISD11YER048W-A 285 nt0.82□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 ECM12YHR021W-A 456 nt0.82□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 PAM16YJL104W 450 nt0.82□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 YJL120WYJL120W 324 nt0.82□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 KAP120YPL125W 3099 nt0.82□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 VIK1YPL253C 1944 nt0.81□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 COG8YML071C 1824 nt0.81□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 ALG13YGL047W 609 nt0.8□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 IES4YOR189W 351 nt0.8□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 snR65snR65 100 nt0.79□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 YGR069WYGR069W 336 nt0.79□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 YMR321CYMR321C 318 nt0.79□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 YOR282WYOR282W 321 nt0.79□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 YPL044CYPL044C 549 nt0.79□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 RAD61YDR014W 1944 nt0.79□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 MCM10YIL150C 1716 nt0.78□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt0.78□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 CSE2YNR010W 450 nt0.78□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 YOR015WYOR015W 360 nt0.78□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 RPS30BYOR182C 192 nt0.78□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt0.78□□□□□ -2.28
FRE8Q12209 RPS27BYHR021C 249 nt0.77□□□□□ -2.29
FRE8Q12209 CMC4YMR194C-B 222 nt0.77□□□□□ -2.29
FRE8Q12209 SGF11YPL047W 300 nt0.77□□□□□ -2.29
FRE8Q12209 PAU24YBR301W 363 nt0.77□□□□□ -2.29
FRE8Q12209 NOP9YJL010C 2001 nt0.76□□□□□ -2.29
FRE8Q12209 PAA1YDR071C 576 nt0.76□□□□□ -2.29
FRE8Q12209 YNL028WYNL028W 318 nt0.75□□□□□ -2.29
FRE8Q12209 YOR218CYOR218C 420 nt0.74□□□□□ -2.29
FRE8Q12209 BFR2YDR299W 1605 nt0.74□□□□□ -2.29
FRE8Q12209 YER181CYER181C 324 nt0.73□□□□□ -2.29
FRE8Q12209 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.73□□□□□ -2.29
FRE8Q12209 YNL211CYNL211C 261 nt0.73□□□□□ -2.29
FRE8Q12209 PMP1YCR024C-A 123 nt0.72□□□□□ -2.29
FRE8Q12209 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.72□□□□□ -2.29
FRE8Q12209 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.71□□□□□ -2.3
FRE8Q12209 YGL052WYGL052W 306 nt0.71□□□□□ -2.3
FRE8Q12209 RPL26BYGR034W 384 nt0.71□□□□□ -2.3
FRE8Q12209 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.71□□□□□ -2.3
FRE8Q12209 RKR1YMR247C 4689 nt0.7□□□□□ -2.3
FRE8Q12209 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.7□□□□□ -2.3
FRE8Q12209 YML099W-AYML099W-A 330 nt0.7□□□□□ -2.3
FRE8Q12209 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.7□□□□□ -2.3
FRE8Q12209 snR74snR74 88 nt0.69□□□□□ -2.3
FRE8Q12209 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.69□□□□□ -2.3
FRE8Q12209 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.69□□□□□ -2.3
FRE8Q12209 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.69□□□□□ -2.3
FRE8Q12209 YPR092WYPR092W 306 nt0.69□□□□□ -2.3
FRE8Q12209 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.68□□□□□ -2.3
FRE8Q12209 YDL073WYDL073W 2955 nt0.67□□□□□ -2.3
FRE8Q12209 NPR2YEL062W 1848 nt0.67□□□□□ -2.3
FRE8Q12209 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.67□□□□□ -2.3
FRE8Q12209 YGL041CYGL041C 204 nt0.66□□□□□ -2.3
FRE8Q12209 UBP3YER151C 2739 nt0.66□□□□□ -2.3
FRE8Q12209 YCR022CYCR022C 345 nt0.65□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.65□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.65□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.65□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.65□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.65□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.65□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 SEC1YDR164C 2175 nt0.64□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.64□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 snR49snR49 165 nt0.64□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 ASE1YOR058C 2658 nt0.64□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 SEC8YPR055W 3198 nt0.63□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 CHS6YJL099W 2241 nt0.63□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.63□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 PAU12YGR294W 363 nt0.63□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.63□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.62□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.62□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 COY1YKL179C 2040 nt0.61□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt0.61□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.61□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 PRP16YKR086W 3216 nt0.61□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 YML002WYML002W 2214 nt0.6□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 snR55snR55 98 nt0.6□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 snR80snR80 171 nt0.6□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 QCR9YGR183C 201 nt0.6□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 snR190snR190 190 nt0.6□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.6□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt0.59□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.59□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.59□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.59□□□□□ -2.31
FRE8Q12209 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt0.58□□□□□ -2.32
FRE8Q12209 ABF2YMR072W 552 nt0.58□□□□□ -2.32
FRE8Q12209 YOR345CYOR345C 351 nt0.58□□□□□ -2.32
FRE8Q12209 YMR160WYMR160W 2451 nt0.58□□□□□ -2.32
FRE8Q12209 FYV10YIL097W 1551 nt0.57□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.8 ms