Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 YDR220CYDR220C 294 nt-0.96□□□□□ -2.56
TY1B-BRQ12193 HUR1YGL168W 333 nt-0.96□□□□□ -2.56
TY1B-BRQ12193 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt-0.96□□□□□ -2.56
TY1B-BRQ12193 PCF11YDR228C 1881 nt-0.97□□□□□ -2.56
TY1B-BRQ12193 RPF1YHR088W 888 nt-0.97□□□□□ -2.56
TY1B-BRQ12193 RPS25BYLR333C 327 nt-0.97□□□□□ -2.56
TY1B-BRQ12193 YPT6YLR262C 648 nt-0.98□□□□□ -2.57
TY1B-BRQ12193 snR161snR161 161 nt-0.98□□□□□ -2.57
TY1B-BRQ12193 YGL015CYGL015C 393 nt-0.98□□□□□ -2.57
TY1B-BRQ12193 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt-0.98□□□□□ -2.57
TY1B-BRQ12193 MRPL32YCR003W 552 nt-0.99□□□□□ -2.57
TY1B-BRQ12193 POP7YBR167C 423 nt-0.99□□□□□ -2.57
TY1B-BRQ12193 TAR1YLR154W-C 375 nt-1□□□□□ -2.57
TY1B-BRQ12193 snR5snR5 204 nt-1.01□□□□□ -2.57
TY1B-BRQ12193 snR72snR72 98 nt-1.01□□□□□ -2.57
TY1B-BRQ12193 YHL041WYHL041W 450 nt-1.01□□□□□ -2.57
TY1B-BRQ12193 HMLALPHA2YCL067C 633 nt-1.01□□□□□ -2.57
TY1B-BRQ12193 MATALPHA2YCR039C 633 nt-1.01□□□□□ -2.57
TY1B-BRQ12193 HMRA2YCR096C 360 nt-1.01□□□□□ -2.57
TY1B-BRQ12193 YPL182CYPL182C 384 nt-1.01□□□□□ -2.57
TY1B-BRQ12193 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-1.03□□□□□ -2.57
TY1B-BRQ12193 YPR039WYPR039W 336 nt-1.03□□□□□ -2.57
TY1B-BRQ12193 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt-1.04□□□□□ -2.58
TY1B-BRQ12193 YCR100CYCR100C 951 nt-1.05□□□□□ -2.58
TY1B-BRQ12193 EST1YLR233C 2100 nt-1.05□□□□□ -2.58
TY1B-BRQ12193 RPL22BYFL034C-A 369 nt-1.06□□□□□ -2.58
TY1B-BRQ12193 APQ13YJL075C 417 nt-1.06□□□□□ -2.58
TY1B-BRQ12193 YDL011CYDL011C 324 nt-1.07□□□□□ -2.58
TY1B-BRQ12193 SDH7YDR511W 402 nt-1.08□□□□□ -2.58
TY1B-BRQ12193 AGA2YGL032C 264 nt-1.08□□□□□ -2.58
TY1B-BRQ12193 YLR334CYLR334C 381 nt-1.08□□□□□ -2.58
TY1B-BRQ12193 YNL058CYNL058C 951 nt-1.08□□□□□ -2.58
TY1B-BRQ12193 TSC3YBR058C-A 243 nt-1.08□□□□□ -2.58
TY1B-BRQ12193 YER079WYER079W 633 nt-1.09□□□□□ -2.58
TY1B-BRQ12193 CMC1YKL137W 336 nt-1.09□□□□□ -2.58
TY1B-BRQ12193 YLR217WYLR217W 324 nt-1.09□□□□□ -2.58
TY1B-BRQ12193 SGF11YPL047W 300 nt-1.09□□□□□ -2.58
TY1B-BRQ12193 YGL230CYGL230C 444 nt-1.1□□□□□ -2.59
TY1B-BRQ12193 YLR041WYLR041W 321 nt-1.1□□□□□ -2.59
TY1B-BRQ12193 YLR282CYLR282C 342 nt-1.1□□□□□ -2.59
TY1B-BRQ12193 YML007C-AYML007C-A 111 nt-1.1□□□□□ -2.59
TY1B-BRQ12193 SNU13YEL026W 381 nt-1.11□□□□□ -2.59
TY1B-BRQ12193 YER175W-AYER175W-A 165 nt-1.11□□□□□ -2.59
TY1B-BRQ12193 CUP1-1YHR053C 186 nt-1.11□□□□□ -2.59
TY1B-BRQ12193 CUP1-2YHR055C 186 nt-1.11□□□□□ -2.59
TY1B-BRQ12193 YCR001WYCR001W 315 nt-1.12□□□□□ -2.59
TY1B-BRQ12193 YER135CYER135C 393 nt-1.12□□□□□ -2.59
TY1B-BRQ12193 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt-1.12□□□□□ -2.59
TY1B-BRQ12193 YML100W-AYML100W-A 174 nt-1.12□□□□□ -2.59
TY1B-BRQ12193 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-1.13□□□□□ -2.59
TY1B-BRQ12193 PAU9YBL108C-A 129 nt-1.13□□□□□ -2.59
TY1B-BRQ12193 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-1.14□□□□□ -2.59
TY1B-BRQ12193 YGR025WYGR025W 303 nt-1.15□□□□□ -2.59
TY1B-BRQ12193 BLI1YKL061W 342 nt-1.15□□□□□ -2.59
TY1B-BRQ12193 YPR092WYPR092W 306 nt-1.15□□□□□ -2.59
TY1B-BRQ12193 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-1.16□□□□□ -2.59
TY1B-BRQ12193 AIM29YKR074W 468 nt-1.16□□□□□ -2.59
TY1B-BRQ12193 FYV7YLR068W 456 nt-1.16□□□□□ -2.59
TY1B-BRQ12193 YDR366CYDR366C 399 nt-1.16□□□□□ -2.6
TY1B-BRQ12193 YMR254CYMR254C 309 nt-1.16□□□□□ -2.6
TY1B-BRQ12193 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt-1.17□□□□□ -2.6
TY1B-BRQ12193 YOR015WYOR015W 360 nt-1.19□□□□□ -2.6
TY1B-BRQ12193 YNL303WYNL303W 348 nt-1.2□□□□□ -2.6
TY1B-BRQ12193 snR9snR9 187 nt-1.21□□□□□ -2.6
TY1B-BRQ12193 YAR029WYAR029W 225 nt-1.21□□□□□ -2.6
TY1B-BRQ12193 ZEO1YOL109W 342 nt-1.21□□□□□ -2.6
TY1B-BRQ12193 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-1.22□□□□□ -2.6
TY1B-BRQ12193 YDR426CYDR426C 378 nt-1.23□□□□□ -2.61
TY1B-BRQ12193 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt-1.23□□□□□ -2.61
TY1B-BRQ12193 YPL068CYPL068C 882 nt-1.23□□□□□ -2.61
TY1B-BRQ12193 MND1YGL183C 660 nt-1.24□□□□□ -2.61
TY1B-BRQ12193 APQ12YIL040W 417 nt-1.24□□□□□ -2.61
TY1B-BRQ12193 YIL032CYIL032C 357 nt-1.25□□□□□ -2.61
TY1B-BRQ12193 YHR130CYHR130C 336 nt-1.26□□□□□ -2.61
TY1B-BRQ12193 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-1.26□□□□□ -2.61
TY1B-BRQ12193 YBL071CYBL071C 309 nt-1.26□□□□□ -2.61
TY1B-BRQ12193 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt-1.26□□□□□ -2.61
TY1B-BRQ12193 YGL182CYGL182C 324 nt-1.28□□□□□ -2.61
TY1B-BRQ12193 SDH6YDR379C-A 240 nt-1.3□□□□□ -2.62
TY1B-BRQ12193 YPL229WYPL229W 621 nt-1.3□□□□□ -2.62
TY1B-BRQ12193 YKL044WYKL044W 321 nt-1.31□□□□□ -2.62
TY1B-BRQ12193 YKL083WYKL083W 615 nt-1.31□□□□□ -2.62
TY1B-BRQ12193 YER084W-AYER084W-A 513 nt-1.33□□□□□ -2.62
TY1B-BRQ12193 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt-1.33□□□□□ -2.62
TY1B-BRQ12193 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt-1.34□□□□□ -2.62
TY1B-BRQ12193 SCEIQ0160 708 nt-1.34□□□□□ -2.62
TY1B-BRQ12193 YBL062WYBL062W 381 nt-1.35□□□□□ -2.63
TY1B-BRQ12193 YFL063WYFL063W 456 nt-1.36□□□□□ -2.63
TY1B-BRQ12193 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-1.37□□□□□ -2.63
TY1B-BRQ12193 YJL182CYJL182C 318 nt-1.39□□□□□ -2.63
TY1B-BRQ12193 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-1.39□□□□□ -2.63
TY1B-BRQ12193 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.42□□□□□ -2.64
TY1B-BRQ12193 snR49snR49 165 nt-1.42□□□□□ -2.64
TY1B-BRQ12193 YFL012WYFL012W 447 nt-1.44□□□□□ -2.64
TY1B-BRQ12193 YLR456WYLR456W 615 nt-1.44□□□□□ -2.64
TY1B-BRQ12193 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-1.44□□□□□ -2.64
TY1B-BRQ12193 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt-1.44□□□□□ -2.64
TY1B-BRQ12193 YJR087WYJR087W 351 nt-1.44□□□□□ -2.64
TY1B-BRQ12193 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-1.45□□□□□ -2.64
TY1B-BRQ12193 YIL029CYIL029C 429 nt-1.47□□□□□ -2.65
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