Protein–RNA interactions for Protein: Q12093

SLM3, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, yeastyeast

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3Q12093 LTE1YAL024C 4308 nt0.87□□□□□ -2.27
SLM3Q12093 KAP120YPL125W 3099 nt0.86□□□□□ -2.27
SLM3Q12093 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.86□□□□□ -2.27
SLM3Q12093 ECM12YHR021W-A 456 nt0.86□□□□□ -2.27
SLM3Q12093 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.86□□□□□ -2.27
SLM3Q12093 IES4YOR189W 351 nt0.86□□□□□ -2.27
SLM3Q12093 SEC1YDR164C 2175 nt0.86□□□□□ -2.27
SLM3Q12093 TRS65YGR166W 1683 nt0.85□□□□□ -2.27
SLM3Q12093 YBR206WYBR206W 324 nt0.85□□□□□ -2.27
SLM3Q12093 ALG13YGL047W 609 nt0.84□□□□□ -2.27
SLM3Q12093 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.84□□□□□ -2.27
SLM3Q12093 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.84□□□□□ -2.27
SLM3Q12093 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.84□□□□□ -2.27
SLM3Q12093 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.84□□□□□ -2.27
SLM3Q12093 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.84□□□□□ -2.27
SLM3Q12093 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt0.84□□□□□ -2.27
SLM3Q12093 snR36snR36 182 nt0.84□□□□□ -2.27
SLM3Q12093 DBP6YNR038W 1890 nt0.84□□□□□ -2.28
SLM3Q12093 YDR102CYDR102C 333 nt0.83□□□□□ -2.28
SLM3Q12093 YDR344CYDR344C 444 nt0.83□□□□□ -2.28
SLM3Q12093 ISD11YER048W-A 285 nt0.83□□□□□ -2.28
SLM3Q12093 OLI1Q0130 231 nt0.83□□□□□ -2.28
SLM3Q12093 YHL042WYHL042W 453 nt0.83□□□□□ -2.28
SLM3Q12093 RPS25BYLR333C 327 nt0.83□□□□□ -2.28
SLM3Q12093 YBR064WYBR064W 429 nt0.83□□□□□ -2.28
SLM3Q12093 SPO21YOL091W 1830 nt0.82□□□□□ -2.28
SLM3Q12093 SSS1YDR086C 243 nt0.82□□□□□ -2.28
SLM3Q12093 YOR282WYOR282W 321 nt0.82□□□□□ -2.28
SLM3Q12093 YDL196WYDL196W 330 nt0.8□□□□□ -2.28
SLM3Q12093 YGL149WYGL149W 306 nt0.8□□□□□ -2.28
SLM3Q12093 CSE2YNR010W 450 nt0.8□□□□□ -2.28
SLM3Q12093 YPL044CYPL044C 549 nt0.8□□□□□ -2.28
SLM3Q12093 PAA1YDR071C 576 nt0.79□□□□□ -2.28
SLM3Q12093 AI1Q0050 2505 nt0.78□□□□□ -2.28
SLM3Q12093 snR60snR60 104 nt0.78□□□□□ -2.28
SLM3Q12093 MCM10YIL150C 1716 nt0.78□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 UTP8YGR128C 2142 nt0.77□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 YIL032CYIL032C 357 nt0.77□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.77□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 YJL120WYJL120W 324 nt0.77□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 YKL136WYKL136W 399 nt0.77□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 SGF11YPL047W 300 nt0.77□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 NOP9YJL010C 2001 nt0.76□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 HTL1YCR020W-B 237 nt0.76□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 YFL032WYFL032W 321 nt0.76□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 RPS27BYHR021C 249 nt0.76□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 YKL118WYKL118W 312 nt0.76□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 YPL225WYPL225W 441 nt0.76□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 IQG1YPL242C 4488 nt0.75□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.75□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 VIK1YPL253C 1944 nt0.74□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 YDR413CYDR413C 576 nt0.74□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.74□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.74□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 ATP6Q0085 780 nt0.73□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 RPL26BYGR034W 384 nt0.73□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.73□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 YNL211CYNL211C 261 nt0.73□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 BFR2YDR299W 1605 nt0.73□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 COG8YML071C 1824 nt0.72□□□□□ -2.29
SLM3Q12093 YFL063WYFL063W 456 nt0.71□□□□□ -2.3
SLM3Q12093 RPL39YJL189W 156 nt0.71□□□□□ -2.3
SLM3Q12093 BUL2YML111W 2763 nt0.71□□□□□ -2.3
SLM3Q12093 PMP1YCR024C-A 123 nt0.69□□□□□ -2.3
SLM3Q12093 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt0.69□□□□□ -2.3
SLM3Q12093 RKR1YMR247C 4689 nt0.69□□□□□ -2.3
SLM3Q12093 NPR2YEL062W 1848 nt0.68□□□□□ -2.3
SLM3Q12093 YNL028WYNL028W 318 nt0.68□□□□□ -2.3
SLM3Q12093 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.67□□□□□ -2.3
SLM3Q12093 YER097WYER097W 330 nt0.67□□□□□ -2.3
SLM3Q12093 STE5YDR103W 2754 nt0.67□□□□□ -2.3
SLM3Q12093 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.64□□□□□ -2.31
SLM3Q12093 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.64□□□□□ -2.31
SLM3Q12093 SEC8YPR055W 3198 nt0.63□□□□□ -2.31
SLM3Q12093 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.63□□□□□ -2.31
SLM3Q12093 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.63□□□□□ -2.31
SLM3Q12093 CHS6YJL099W 2241 nt0.61□□□□□ -2.31
SLM3Q12093 YML002WYML002W 2214 nt0.61□□□□□ -2.31
SLM3Q12093 COX5BYIL111W 456 nt0.61□□□□□ -2.31
SLM3Q12093 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.61□□□□□ -2.31
SLM3Q12093 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.61□□□□□ -2.31
SLM3Q12093 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.61□□□□□ -2.31
SLM3Q12093 snR190snR190 190 nt0.61□□□□□ -2.31
SLM3Q12093 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.6□□□□□ -2.31
SLM3Q12093 RAD61YDR014W 1944 nt0.59□□□□□ -2.32
SLM3Q12093 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.58□□□□□ -2.32
SLM3Q12093 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.58□□□□□ -2.32
SLM3Q12093 THO2YNL139C 4794 nt0.57□□□□□ -2.32
SLM3Q12093 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.57□□□□□ -2.32
SLM3Q12093 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.57□□□□□ -2.32
SLM3Q12093 ASE1YOR058C 2658 nt0.56□□□□□ -2.32
SLM3Q12093 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.56□□□□□ -2.32
SLM3Q12093 YGR069WYGR069W 336 nt0.56□□□□□ -2.32
SLM3Q12093 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.56□□□□□ -2.32
SLM3Q12093 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.56□□□□□ -2.32
SLM3Q12093 COY1YKL179C 2040 nt0.55□□□□□ -2.32
SLM3Q12093 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.55□□□□□ -2.32
SLM3Q12093 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.55□□□□□ -2.32
SLM3Q12093 YLR282CYLR282C 342 nt0.55□□□□□ -2.32
SLM3Q12093 FYV10YIL097W 1551 nt0.54□□□□□ -2.32
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