Protein–RNA interactions for Protein: Q12027

YDL176W, Uncharacterized protein YDL176W, yeastyeast

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL176WQ12027 TCB2YNL087W 3537 nt2.42□□□□□ -2.02
YDL176WQ12027 COA6YMR244C-A 315 nt2.42□□□□□ -2.02
YDL176WQ12027 YEF3YLR249W 3135 nt2.42□□□□□ -2.02
YDL176WQ12027 AZF1YOR113W 2745 nt2.41□□□□□ -2.02
YDL176WQ12027 PET111YMR257C 2403 nt2.41□□□□□ -2.02
YDL176WQ12027 SMC1YFL008W 3678 nt2.41□□□□□ -2.02
YDL176WQ12027 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt2.41□□□□□ -2.02
YDL176WQ12027 SPO24YPR036W-A 204 nt2.41□□□□□ -2.02
YDL176WQ12027 EMC5YIL027C 426 nt2.4□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.4□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt2.4□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 AI1Q0050 2505 nt2.4□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 SAP185YJL098W 3177 nt2.4□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 BUB1YGR188C 3066 nt2.4□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 SCP160YJL080C 3669 nt2.39□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt2.39□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 snR38snR38 95 nt2.39□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 NUM1YDR150W 8247 nt2.38□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 YPR097WYPR097W 3222 nt2.38□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 RPO41YFL036W 4056 nt2.37□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 KRE33YNL132W 3171 nt2.37□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 RPL26BYGR034W 384 nt2.37□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 YJR039WYJR039W 3366 nt2.37□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 MSH5YDL154W 2706 nt2.37□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 AGC1YPR021C 2709 nt2.37□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 YER138CYER138C 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 YER160CYER160C 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 YJR027WYJR027W 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 YML039WYML039W 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 YML045WYML045W 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 YMR050CYMR050C 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.36□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.36□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 POL5YEL055C 3069 nt2.35□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 SCD5YOR329C 2619 nt2.35□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 FAR11YNL127W 2862 nt2.35□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 ANS1YHR126C 480 nt2.35□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 NUP100YKL068W 2880 nt2.35□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 ARP8YOR141C 2646 nt2.35□□□□□ -2.03
YDL176WQ12027 TRA1YHR099W 11235 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL176WQ12027 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL176WQ12027 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL176WQ12027 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL176WQ12027 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL176WQ12027 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL176WQ12027 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL176WQ12027 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL176WQ12027 YML054C-AYML054C-A 159 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL176WQ12027 PDR1YGL013C 3207 nt2.32□□□□□ -2.04
YDL176WQ12027 AMS1YGL156W 3252 nt2.32□□□□□ -2.04
YDL176WQ12027 CSF1YLR087C 8877 nt2.31□□□□□ -2.04
YDL176WQ12027 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL176WQ12027 NIP1YMR309C 2439 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL176WQ12027 PDR3YBL005W 2931 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL176WQ12027 BNR1YIL159W 4128 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL176WQ12027 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL176WQ12027 GCN2YDR283C 4980 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL176WQ12027 ALY2YJL084C 3141 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL176WQ12027 YOR055WYOR055W 435 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL176WQ12027 NNF2YGR089W 2811 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL176WQ12027 PSD2YGR170W 3417 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL176WQ12027 RGA1YOR127W 3024 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL176WQ12027 CBF2YGR140W 2871 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL176WQ12027 INP51YIL002C 2841 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL176WQ12027 SLN1YIL147C 3663 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL176WQ12027 IRE1YHR079C 3348 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL176WQ12027 IRA2YOL081W 9240 nt2.26□□□□□ -2.05
YDL176WQ12027 CTR9YOL145C 3234 nt2.26□□□□□ -2.05
YDL176WQ12027 PET127YOR017W 2403 nt2.26□□□□□ -2.05
YDL176WQ12027 SYH1YPL105C 2550 nt2.25□□□□□ -2.05
YDL176WQ12027 TOF1YNL273W 3717 nt2.25□□□□□ -2.05
YDL176WQ12027 VPS13YLL040C 9435 nt2.25□□□□□ -2.05
YDL176WQ12027 GYP5YPL249C 2685 nt2.24□□□□□ -2.05
YDL176WQ12027 snR190snR190 190 nt2.24□□□□□ -2.05
YDL176WQ12027 SPF1YEL031W 3648 nt2.24□□□□□ -2.05
YDL176WQ12027 MYO2YOR326W 4725 nt2.23□□□□□ -2.05
YDL176WQ12027 CHS1YNL192W 3396 nt2.23□□□□□ -2.05
YDL176WQ12027 CHC1YGL206C 4962 nt2.23□□□□□ -2.05
YDL176WQ12027 EST1YLR233C 2100 nt2.21□□□□□ -2.06
YDL176WQ12027 RAD9YDR217C 3930 nt2.21□□□□□ -2.06
YDL176WQ12027 YDL073WYDL073W 2955 nt2.21□□□□□ -2.06
YDL176WQ12027 FKS3YMR306W 5358 nt2.21□□□□□ -2.06
YDL176WQ12027 DNA2YHR164C 4569 nt2.2□□□□□ -2.06
YDL176WQ12027 PET309YLR067C 2898 nt2.19□□□□□ -2.06
YDL176WQ12027 snR70snR70 164 nt2.19□□□□□ -2.06
YDL176WQ12027 TRL1YJL087C 2484 nt2.19□□□□□ -2.06
YDL176WQ12027 VPS8YAL002W 3825 nt2.18□□□□□ -2.06
YDL176WQ12027 HSL1YKL101W 4557 nt2.17□□□□□ -2.06
YDL176WQ12027 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt2.17□□□□□ -2.06
YDL176WQ12027 SGS1YMR190C 4344 nt2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.7 ms