Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms