Protein–RNA interactions for Protein: Q08729

DSE3, Protein DSE3, yeastyeast

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE3Q08729 PTP2YOR208W 2253 nt1.57□□□□□ -2.16
DSE3Q08729 IRE1YHR079C 3348 nt1.57□□□□□ -2.16
DSE3Q08729 NCA2YPR155C 1851 nt1.57□□□□□ -2.16
DSE3Q08729 YEL073CYEL073C 324 nt1.57□□□□□ -2.16
DSE3Q08729 AIM44YPL158C 2277 nt1.57□□□□□ -2.16
DSE3Q08729 HAL9YOL089C 3093 nt1.57□□□□□ -2.16
DSE3Q08729 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.56□□□□□ -2.16
DSE3Q08729 KCS1YDR017C 3153 nt1.56□□□□□ -2.16
DSE3Q08729 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.55□□□□□ -2.16
DSE3Q08729 COG4YPR105C 2586 nt1.55□□□□□ -2.16
DSE3Q08729 SLD3YGL113W 2007 nt1.54□□□□□ -2.16
DSE3Q08729 PKH2YOL100W 3246 nt1.54□□□□□ -2.16
DSE3Q08729 FRK1YPL141C 2598 nt1.53□□□□□ -2.16
DSE3Q08729 PRP42YDR235W 1635 nt1.52□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.52□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 YPL044CYPL044C 549 nt1.52□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 PBY1YBR094W 2262 nt1.51□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 MSH6YDR097C 3729 nt1.51□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.51□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 SLI15YBR156C 2097 nt1.51□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 COX12YLR038C 252 nt1.5□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 RPS30BYOR182C 192 nt1.5□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 YGR130CYGR130C 2451 nt1.5□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 SEC63YOR254C 1992 nt1.5□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 CDC25YLR310C 4770 nt1.48□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.48□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 PAA1YDR071C 576 nt1.48□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.48□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.48□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.48□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.48□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.48□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.48□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.48□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.48□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 snR48snR48 113 nt1.48□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 MON2YNL297C 4911 nt1.48□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 SSK2YNR031C 4740 nt1.48□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 HUG1YML058W-A 207 nt1.47□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 YNL205CYNL205C 423 nt1.47□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 NUT1YGL151W 3399 nt1.47□□□□□ -2.17
DSE3Q08729 STF2YGR008C 255 nt1.46□□□□□ -2.18
DSE3Q08729 SXM1YDR395W 2835 nt1.46□□□□□ -2.18
DSE3Q08729 HKR1YDR420W 5409 nt1.45□□□□□ -2.18
DSE3Q08729 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.45□□□□□ -2.18
DSE3Q08729 IML1YJR138W 4755 nt1.45□□□□□ -2.18
DSE3Q08729 PMD1YER132C 5262 nt1.44□□□□□ -2.18
DSE3Q08729 RAD50YNL250W 3939 nt1.44□□□□□ -2.18
DSE3Q08729 FYV8YGR196C 2454 nt1.43□□□□□ -2.18
DSE3Q08729 PIK1YNL267W 3201 nt1.43□□□□□ -2.18
DSE3Q08729 snR14snR14 160 nt1.43□□□□□ -2.18
DSE3Q08729 TRM732YMR259C 4263 nt1.43□□□□□ -2.18
DSE3Q08729 YDL206WYDL206W 2289 nt1.42□□□□□ -2.18
DSE3Q08729 snR85snR85 171 nt1.42□□□□□ -2.18
DSE3Q08729 EMC5YIL027C 426 nt1.42□□□□□ -2.18
DSE3Q08729 TTI1YKL033W 3117 nt1.42□□□□□ -2.18
DSE3Q08729 SKI3YPR189W 4299 nt1.41□□□□□ -2.18
DSE3Q08729 YJL022WYJL022W 309 nt1.41□□□□□ -2.18
DSE3Q08729 APL1YJR005W 2103 nt1.41□□□□□ -2.18
DSE3Q08729 YOR102WYOR102W 351 nt1.41□□□□□ -2.18
DSE3Q08729 SLX4YLR135W 2247 nt1.41□□□□□ -2.18
DSE3Q08729 ALY2YJL084C 3141 nt1.4□□□□□ -2.18
DSE3Q08729 SMC4YLR086W 4257 nt1.4□□□□□ -2.19
DSE3Q08729 SNU13YEL026W 381 nt1.4□□□□□ -2.19
DSE3Q08729 YNL211CYNL211C 261 nt1.4□□□□□ -2.19
DSE3Q08729 SEC21YNL287W 2808 nt1.4□□□□□ -2.19
DSE3Q08729 PET127YOR017W 2403 nt1.4□□□□□ -2.19
DSE3Q08729 NUP157YER105C 4176 nt1.4□□□□□ -2.19
DSE3Q08729 UFD2YDL190C 2886 nt1.39□□□□□ -2.19
DSE3Q08729 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.39□□□□□ -2.19
DSE3Q08729 BST1YFL025C 3090 nt1.38□□□□□ -2.19
DSE3Q08729 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.38□□□□□ -2.19
DSE3Q08729 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.37□□□□□ -2.19
DSE3Q08729 YAR009CYAR009C 3591 nt1.37□□□□□ -2.19
DSE3Q08729 MSN5YDR335W 3675 nt1.36□□□□□ -2.19
DSE3Q08729 PAN2YGL094C 3348 nt1.36□□□□□ -2.19
DSE3Q08729 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.36□□□□□ -2.19
DSE3Q08729 KAP122YGL016W 3246 nt1.36□□□□□ -2.19
DSE3Q08729 YLL054CYLL054C 2532 nt1.35□□□□□ -2.19
DSE3Q08729 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.35□□□□□ -2.19
DSE3Q08729 RSM22YKL155C 1887 nt1.35□□□□□ -2.19
DSE3Q08729 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.34□□□□□ -2.19
DSE3Q08729 MMS4YBR098W 2076 nt1.34□□□□□ -2.19
DSE3Q08729 PRP5YBR237W 2550 nt1.34□□□□□ -2.2
DSE3Q08729 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.33□□□□□ -2.2
DSE3Q08729 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.33□□□□□ -2.2
DSE3Q08729 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt1.33□□□□□ -2.2
DSE3Q08729 SIP4YJL089W 2490 nt1.33□□□□□ -2.2
DSE3Q08729 NST1YNL091W 3723 nt1.32□□□□□ -2.2
DSE3Q08729 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.31□□□□□ -2.2
DSE3Q08729 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.31□□□□□ -2.2
DSE3Q08729 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.31□□□□□ -2.2
DSE3Q08729 STO1YMR125W 2586 nt1.31□□□□□ -2.2
DSE3Q08729 BFR2YDR299W 1605 nt1.3□□□□□ -2.2
DSE3Q08729 SET3YKR029C 2256 nt1.3□□□□□ -2.2
DSE3Q08729 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt1.3□□□□□ -2.2
DSE3Q08729 YCS4YLR272C 3531 nt1.3□□□□□ -2.2
DSE3Q08729 EAF1YDR359C 2949 nt1.29□□□□□ -2.2
DSE3Q08729 CMC4YMR194C-B 222 nt1.28□□□□□ -2.2
DSE3Q08729 EST2YLR318W 2655 nt1.28□□□□□ -2.2
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