Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms