Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms