Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms