Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms