Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms