Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms