Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX1T1Q06455 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX1T1Q06455 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX1T1Q06455 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms