Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms