Protein–RNA interactions for Protein: Q06091

SNT309, Pre-mRNA-splicing factor SNT309, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNT309Q06091 CDC39YCR093W 6327 nt0.94□□□□□ -2.26
SNT309Q06091 COG8YML071C 1824 nt0.94□□□□□ -2.26
SNT309Q06091 YDR344CYDR344C 444 nt0.93□□□□□ -2.26
SNT309Q06091 SGF11YPL047W 300 nt0.93□□□□□ -2.26
SNT309Q06091 NST1YNL091W 3723 nt0.92□□□□□ -2.26
SNT309Q06091 INA22YIR024C 651 nt0.91□□□□□ -2.26
SNT309Q06091 CMC4YMR194C-B 222 nt0.91□□□□□ -2.26
SNT309Q06091 MCM10YIL150C 1716 nt0.91□□□□□ -2.26
SNT309Q06091 NOP9YJL010C 2001 nt0.9□□□□□ -2.27
SNT309Q06091 RPL26BYGR034W 384 nt0.89□□□□□ -2.27
SNT309Q06091 YNL146WYNL146W 303 nt0.89□□□□□ -2.27
SNT309Q06091 YPR117WYPR117W 7470 nt0.88□□□□□ -2.27
SNT309Q06091 YDL196WYDL196W 330 nt0.88□□□□□ -2.27
SNT309Q06091 RAD61YDR014W 1944 nt0.87□□□□□ -2.27
SNT309Q06091 SCC2YDR180W 4482 nt0.87□□□□□ -2.27
SNT309Q06091 BEM2YER155C 6504 nt0.86□□□□□ -2.27
SNT309Q06091 YNL211CYNL211C 261 nt0.86□□□□□ -2.27
SNT309Q06091 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.86□□□□□ -2.27
SNT309Q06091 snR65snR65 100 nt0.85□□□□□ -2.27
SNT309Q06091 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.85□□□□□ -2.27
SNT309Q06091 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.85□□□□□ -2.27
SNT309Q06091 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.85□□□□□ -2.27
SNT309Q06091 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.85□□□□□ -2.27
SNT309Q06091 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.85□□□□□ -2.27
SNT309Q06091 KAP120YPL125W 3099 nt0.85□□□□□ -2.27
SNT309Q06091 YGR069WYGR069W 336 nt0.84□□□□□ -2.27
SNT309Q06091 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.83□□□□□ -2.28
SNT309Q06091 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.83□□□□□ -2.28
SNT309Q06091 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.83□□□□□ -2.28
SNT309Q06091 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.82□□□□□ -2.28
SNT309Q06091 PAU24YBR301W 363 nt0.82□□□□□ -2.28
SNT309Q06091 PMP1YCR024C-A 123 nt0.8□□□□□ -2.28
SNT309Q06091 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.8□□□□□ -2.28
SNT309Q06091 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.8□□□□□ -2.28
SNT309Q06091 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt0.8□□□□□ -2.28
SNT309Q06091 BFR2YDR299W 1605 nt0.79□□□□□ -2.28
SNT309Q06091 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.79□□□□□ -2.28
SNT309Q06091 DOP1YDR141C 5097 nt0.79□□□□□ -2.28
SNT309Q06091 YGL052WYGL052W 306 nt0.78□□□□□ -2.28
SNT309Q06091 YPR092WYPR092W 306 nt0.78□□□□□ -2.28
SNT309Q06091 SEC8YPR055W 3198 nt0.78□□□□□ -2.28
SNT309Q06091 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.77□□□□□ -2.29
SNT309Q06091 NPR2YEL062W 1848 nt0.77□□□□□ -2.29
SNT309Q06091 UBP3YER151C 2739 nt0.76□□□□□ -2.29
SNT309Q06091 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.76□□□□□ -2.29
SNT309Q06091 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.76□□□□□ -2.29
SNT309Q06091 PRP16YKR086W 3216 nt0.75□□□□□ -2.29
SNT309Q06091 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.74□□□□□ -2.29
SNT309Q06091 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.74□□□□□ -2.29
SNT309Q06091 YOR015WYOR015W 360 nt0.74□□□□□ -2.29
SNT309Q06091 snR190snR190 190 nt0.74□□□□□ -2.29
SNT309Q06091 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.73□□□□□ -2.29
SNT309Q06091 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.73□□□□□ -2.29
SNT309Q06091 SEC1YDR164C 2175 nt0.72□□□□□ -2.29
SNT309Q06091 BLI1YKL061W 342 nt0.72□□□□□ -2.29
SNT309Q06091 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.72□□□□□ -2.29
SNT309Q06091 RKR1YMR247C 4689 nt0.71□□□□□ -2.3
SNT309Q06091 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.7□□□□□ -2.3
SNT309Q06091 COX5BYIL111W 456 nt0.7□□□□□ -2.3
SNT309Q06091 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt0.7□□□□□ -2.3
SNT309Q06091 COY1YKL179C 2040 nt0.69□□□□□ -2.3
SNT309Q06091 PAM16YJL104W 450 nt0.69□□□□□ -2.3
SNT309Q06091 YLR282CYLR282C 342 nt0.69□□□□□ -2.3
SNT309Q06091 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt0.69□□□□□ -2.3
SNT309Q06091 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.69□□□□□ -2.3
SNT309Q06091 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.69□□□□□ -2.3
SNT309Q06091 snR49snR49 165 nt0.69□□□□□ -2.3
SNT309Q06091 YML002WYML002W 2214 nt0.69□□□□□ -2.3
SNT309Q06091 CHS6YJL099W 2241 nt0.68□□□□□ -2.3
SNT309Q06091 YER181CYER181C 324 nt0.68□□□□□ -2.3
SNT309Q06091 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.68□□□□□ -2.3
SNT309Q06091 snR55snR55 98 nt0.67□□□□□ -2.3
SNT309Q06091 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.67□□□□□ -2.3
SNT309Q06091 LTE1YAL024C 4308 nt0.67□□□□□ -2.3
SNT309Q06091 YML099W-AYML099W-A 330 nt0.66□□□□□ -2.3
SNT309Q06091 ASE1YOR058C 2658 nt0.65□□□□□ -2.3
SNT309Q06091 snR74snR74 88 nt0.65□□□□□ -2.31
SNT309Q06091 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.65□□□□□ -2.31
SNT309Q06091 FYV10YIL097W 1551 nt0.63□□□□□ -2.31
SNT309Q06091 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SNT309Q06091 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SNT309Q06091 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SNT309Q06091 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SNT309Q06091 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SNT309Q06091 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SNT309Q06091 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SNT309Q06091 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SNT309Q06091 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SNT309Q06091 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SNT309Q06091 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SNT309Q06091 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.62□□□□□ -2.31
SNT309Q06091 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.62□□□□□ -2.31
SNT309Q06091 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.62□□□□□ -2.31
SNT309Q06091 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.62□□□□□ -2.31
SNT309Q06091 BEM3YPL115C 3387 nt0.62□□□□□ -2.31
SNT309Q06091 YKU70YMR284W 1809 nt0.61□□□□□ -2.31
SNT309Q06091 YDL073WYDL073W 2955 nt0.61□□□□□ -2.31
SNT309Q06091 RPS30BYOR182C 192 nt0.61□□□□□ -2.31
SNT309Q06091 PRP42YDR235W 1635 nt0.6□□□□□ -2.31
SNT309Q06091 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.6□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.4 ms