Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms