Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCZQ05513 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms