Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3AQ05086 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3AQ05086 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3AQ05086 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3AQ05086 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3AQ05086 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3AQ05086 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3AQ05086 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3AQ05086 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3AQ05086 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3AQ05086 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3AQ05086 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3AQ05086 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3AQ05086 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3AQ05086 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3AQ05086 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3AQ05086 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3AQ05086 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3AQ05086 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3AQ05086 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3AQ05086 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3AQ05086 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3AQ05086 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3AQ05086 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3AQ05086 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3AQ05086 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBE3AQ05086 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3AQ05086 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3AQ05086 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBE3AQ05086 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3AQ05086 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBE3AQ05086 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms