Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLOD1Q02809 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms