Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms